学校以实施“学校特色建设、特色品牌”工程为抓手，培育特色项目，培植特色品牌，培养特长人才，在更高的特色品位上创新发展。几年来，学校分别在学校管理、学生教育、学生素养三个方面进行了积极探索和实践，不断强化、深化、亮化“信息技术与学校教育教学有效整合”、“心理健康教育与法制教育有机结合”、“体育艺术特长教育”这三大特色工程，正实践探索着一条符合学校校情的改革、发展、创新、高效的特色办学之路，努力实现“办规范加特色学校、育合格加特长人才”的特色强校目标，促进了办学水平的全面提高，在江阴市具有了一定的影响，也给学校带来了良好的社会声誉。
学校于1999年元月圆满通过省基本实现教育现代化评估验收，2002年顺利通过了“无锡市现代教育技术实验学校”、“无锡市实验教学标准化学校”考核验收。2005年顺利通过了“江苏省实施教育现代化工程示范初中”、“江苏省现代教育技术实验学校”评估验收。学校先后被评为“全国中小学信息技术实践与创新先进单位”、“全国德育科研先进实验学校”、“全国中小学信息技术创新应用示范学校”、教育部信息技术管理中心“全国信息技术教学应用创新示范学校”、2007中国基础教育网 “基础教育教改实验学校”、“全国心理健康教育特色学校”、 “江苏省科技教育先进学校”、“无锡市德育先进学校”、“无锡市爱国卫生先进单位”、 “无锡市文明单位”、 “无锡市四五普法先进单位”、“无锡市心理健康教育示范学校”、“无锡市绿色学校”、“无锡市绿色网吧学校”、“无锡市绿色网吧学校”、“无锡市先进教工之家”、“江阴市管理一类学校”、“江阴市心理健康教育示范学校”、“江阴市安全文明校园”、“江阴市常规管理先进学校”、“江阴市关心下一代工作先进集体”、“江阴市绿色学校”、“江阴市AAA级特色学校” 、“江阴市教育信息化应用示范学校入围单位”，，先后获得“扬州大学教科研基地”、“全国十五规划课题实验学校”、“无锡市新课程资源建设基地”等荣誉称号，连续多年被评为江阴市文明单位。
薛少君词
澄杨路旁，定山脚下，飘扬着我们的校旗，
应天河畔，云南路上，响彻着我们的歌声；
早晨，伴随着初升的太阳，教室里有我们琅琅的书声，
傍晚，满载着收获的喜悦，校园里有我们尽情的欢笑。
全面发展，学有特长，是我们奋斗的方向，
打好基础，张扬个性，是我们不懈的追求！
啊，云亭中学，学习的乐园，
我们为您感到骄傲！
啊，云亭中学，成长的摇篮，
我们为您感到自豪！
春去冬来，我们在云中的怀抱中成长，
斗转星移，我们在云中的培育下成长。
各行各业，呼唤着云中学子的名字，
五湖四海，活跃着云中学子的身影；
啊，几十载春秋，铸就了云中人志勤的品质，
啊，几十个年华，熔炼了云中人有为的品格；
新的世纪，新的航程，云中人斗志昂扬，
新的目标，新的追求，云中人再创辉煌，
再创辉煌！
办学理念：面向全体抓基础，培育个性展特长
办学目标：现代化、高质量、有特色
办学方向：办规范加特色学校，育合格加特长人才
学校的办学理念是“面向全体抓基础，培育个性展特长”。“面向全体抓基础”就是要面向全体学生，关注学生的全面发展，均衡发展，和谐发展，为学生的终身发展和一生幸福奠定坚实的基础；“培育个性展特长”就是要坚持以生为本，尊重学生个性特长，充分挖掘学生潜能，关注学生的创新发展，个性发展，特长发展，培养“合格加特长，主动加创造”的未来发展人才。
学校的办学目标是“现代化、高质量、有特色”。“现代化”就是要实现办学条件现代化，学校管理现代化，教育理念现代化，教师素养现代化，学生素质现代化；“高质量”就是要做到严格执行教育法规，切实减轻学生负担，学生发展健康阳光，教学质量名列前茅；“有特色”就是要追求学校品牌特色鲜亮，教师风格特点鲜明，学生个性特长鲜活。